华南植物园前身是国立中山大学农林植物研究所，由著名植物学家陈焕镛院士创建于1929年。1954年改隶中国科学院后为华南植物研究所，2003年10月更名为中国科学院华南植物园。现有正式员工323人，流动人员148人，博士生导师18人，研究员22人，副高级专业职务人员33人。拥有博士学位授予点2个（植物学、生态学）和硕士学位授予点3个（植物学、生态学、生物化学和分子生物学），在读研究生145人，其中博士研究生64人，硕士研究生81人。
从50年代初期开始，我园开始进行系统的学科规划，围绕热带亚热带植物资源的研究、开发利用和保护，先后建立了植物分类、植物生态、植物生理、植物资源、植物形态解剖和植物遗传6个研究室。为了国家的热带亚热带植物战略资源的储备，先后建立了华南植物园、广西植物所、武汉植物园、鼎湖山树木园，创建了鼎湖山自然保护区，开创了我国自然保护事业的先河。根据国家和中科院关于"植被改造自然"的部署，建立了热带亚热带第一个定位站--小良热带人工林生态系统定位研究站，而后又建立了鼎湖山森林生态系统定位研究站，鹤山丘陵综合试验站，进行长期的野外研究。从此确立了我园在植物学多学科综合研究不可替代的地位。
华南植物园2002年上半年顺利进入中科院知识创新工程试点序列；2002年下半年又完成了所园一体化的结构性调整。目前全园的机构设置分为四大模块：管理模块、科研模块、产业模块和待聘模块。主要学科方向是：面向国家重大需求和学科发展前沿，围绕退化生态系统的恢复与重建、环境与生态安全、物种的演化形成与维持、植物资源储备与可持续利用，进行基础性、前瞻性和战略性研究，成为我国科技创新、人才培养与科学知识传播的重要基地，并在恢复生态学与系统演化植物学领域发展成为世界公认的高水平综合性植物园；产业模块包含华南植物园管理责任有限公司（暂名）和广东中科琪林股份有限公司；
华南植物园占地面积300公顷，引种热带亚热带植物6000种，拥有世界一流的木兰科、姜科植物专类园，是全国科普教育基地和广州市"十佳旅游景点"。
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